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活体单细胞成像揭示生物钟发育过程

活体单细胞成像揭示生物钟发育过程

2021-08-24

PLOS Biology 期刊在线发表了题为《斑马鱼生物钟的活体单细胞成像》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室严军研究组、何杰研究组与安徽医科大学附属第一医院教授李元海合作完成。该研究成功构建了可以活体实时观测斑马鱼单细胞节律的报告基因系统,并 3月14日,PLOS Biology 期刊在线发表了...

研究人员提升声学报告基因灵敏度,可深入观察研究单个细胞

研究人员提升声学报告基因灵敏度,可深入观察研究单个细胞

2021-08-23

加州理工学院研究人员在《自然·方法》上发表研究介绍,其研制的声学报告基因(acoustic reporter genes)灵敏度提升,能够对单个细胞进行成像研究。报告基因是一段特殊的DNA片段,通常编码荧光蛋白,可插入基因组内用于检测特定基因表达情况。比如,将报告基因插在神经元发育基因旁边,当神经元基因被激活时就会产生荧光蛋白分子。而荧光报告基因一大缺点是光无法穿透到活体组织的深处。加州理工研...

研究人员开发出基于可寻址动态液滴阵列的单细胞测序技术

研究人员开发出基于可寻址动态液滴阵列的单细胞测序技术

2021-08-20

 单细胞基因组测序是生命科学与生物技术的共性使能技术之一,但其推广应用面临诸多瓶颈。一方面,单个细胞的核酸含量低,为满足测序所需核酸量通常须大幅增加扩增循环数,这将极度放大基因组DNA扩增的偏好性,从而大幅度降低单细胞全基因组覆盖率;同时,单细胞的分离获取、裂解、扩增等过程通常十分繁琐,其操作困难、易于污染。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发出一种模块式的可寻址动态液...

Nature:浙江大学领衔在构建全面的人类单细胞图谱方面取得重大进展

Nature:浙江大学领衔在构建全面的人类单细胞图谱方面取得重大进展

2021-08-20

在一项新的研究中,来自中国浙江大学等研究机构的研究人员朝构建全面的人类单细胞图谱迈出了一大步。相关研究结果在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在这篇论文中,他们描述了他们对志愿者捐赠的50多万个细胞的RNA进行测序,以及如何处理这些信息从而以一种可用于单细胞图谱的方式进行...

Nat Med:超急性期HIV-1感染多细胞免疫动力学的单细胞综合分析

Nat Med:超急性期HIV-1感染多细胞免疫动力学的单细胞综合分析

2021-08-20

细胞免疫是控制细胞内病原体的关键,但在进化的人类免疫反应中,个体细胞动力学和细胞-细胞协同性仍然知之甚少。单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一个强有力的工具,可以用来分析健康和疾病中复杂的多细胞行为,并鉴定可测试的治疗靶点。将其应用于纵向样本可以提供一个揭示与疾病进展演变相关的细胞因子的机会,而不会潜在地混淆个体间的多样性。图片来源:https://cn.bing.com为此来自哈佛和MIT...

Nature深度解析!在单细胞环境中发现遗传连锁反应!

Nature深度解析!在单细胞环境中发现遗传连锁反应!

2021-08-19

尽管遗传学和基因组学的进展揭示了许多与疾病相关的基因突变,但医生和研究人员仍然面临着将这些突变与实际致病过程联系起来的棘手挑战。再加上单细胞生物学的不断发展,它能在特定时刻检测每个细胞的基因和/或蛋白质的表达,这项任务变得更加艰巨。现在,辛辛那提儿童医院医学中心的研究人员在Nature杂志上发表了一篇研究报告,他们开发了一种分子工作流程,利用单细胞方法来了解与特定患者基因突变相关的分子通路。科学家...

Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2

Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2

2021-08-19

为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法,日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自西班牙的科学家们通过研究发现,日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源:CC0 Public Domain此前,用于基因组分析的方法缺乏一定的基准,这就会在后来的分析过程中产生许多问题,...

《细胞》亮点:庄小威联合团队看清染色质转录动态;单细胞测序揭示肺癌难根治原因

《细胞》亮点:庄小威联合团队看清染色质转录动态;单细胞测序揭示肺癌难根治原因

2021-08-18

 顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术,能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出,染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构,无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此,研究人员 顶尖学术期刊《细胞》在线发表...

科学家创建了基于小鼠的胚胎大脑发育分子图谱

科学家创建了基于小鼠的胚胎大脑发育分子图谱

2021-08-17

 近日,发表在《Nature》上的一项研究中,来自瑞典卡罗林斯卡医学院领导的研究团队利用单细胞技术开发出一份详细的小鼠胚胎大脑发育分子图谱。利用这份图谱,研究人员已经识别出近800种在胎儿发育过程中活跃的不同细胞,这比已知的多出许多倍。在这项研究中,研究人员跟踪了小鼠的大脑发育,从大脑刚刚形成的第七天到怀孕结束的第18天。利用单细胞技术,他们能够确定胎儿发育期间大脑的详细构成,如:存在哪...

bioRixv:单细胞分析和机器学习确定了COVID-19的主要靶点

bioRixv:单细胞分析和机器学习确定了COVID-19的主要靶点

2021-08-16

耶鲁大学医学院的科学家们正在利用单细胞RNA测序来研究SARS-CoV-2如何与宿主细胞相互作用。心血管医学和计算机科学部医学助理教授David van Dijk博士和实验室医学和免疫生物学助理教授Craig Wilen博士利用被感染的人类支气管上皮细胞(HBECs)的单细胞RNA序列数据来确定病毒如何感染和改变健康细胞。在bioRxiv预印本服务器上发表的这项研究中,作者确定了纤毛细胞是SARS...

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